Alfresco almacena sus contenidos en base de datos y en el sistema de ficheros.
Cuando utilizas Alfresco Enterprise (esta funcionalidad no está disponible en Community), puedes emplear un Content Store Selector. Esta característica te permite almacenar los contenidos en Content Stores diferentes de acuerdo a un criterio (por ejemplo, la fecha de creación).
Content Store Selector full configuration example | Alfresco Documentation
Cada Content Store se almacena en un sistema de ficheros diferente, pero utiliza la misma base de datos.
Lo que sugieres parece más bien una instalación doble de Alfresco, para documentos de oficina y documentos de archivo. Con un espacio intermedio de transferencia. Este esquema puede realizare pero requiere algo de desarrollo además de la configuración.
Puedes tener el Content Store Selector con la versión Community usando el siguiente complemento
Discussions about Alfresco Content Services and Alfresco Process Services in Spanish
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