Pour éclaircir le sujet (enfin essayer).
Il devient difficile de faire la liste des différence car de nombreuses améliorations vont arriver avec la prochaine version. Ceci dit si on ne parle que de ce qui est le plus demandé dans les versions actuelles et qui sera placé sous licence libre : Le support LDAP et la notion de groupes d'utilisateurs. Pour le reste se reporter au lien donné par Arnaud.
La version entreprise (les noms ne sont pas figés) n'aura plus d'existence d'un point de vue technique. De même la version pro disparait complètement car elle n'a plus de justification.
Il n'y aura donc qu'une seule version d'Alfresco à partir de la version 1.3.
Acheter une licence ce sera acheter une offre de service : support technique, garantie, offres de mise à jour, accès aux développeurs, formation, …
Bien sûr il ne faut pas perdre de vue que souscrire à cette offre de service (qui est à un tarif plus qu'attractif à mon avis), c'est aussi soutenir et faire avancer le projet, et conforter les développeurs dans le choix de libérer le code (c'est tout de même assez courageux).