Hola de nuevo.
Creo que he resuelto el problema, no sé si será la forma ortodoxa, pero os cuento como lo he hecho.
Copia de la base de datos y del alf_data (por si acaso…. ).
Paro el servicio de Alfresco.
Exporté la base de datos (por ahora no es muy grande ) a texto y busqué el nodo que daba problemas (bf0b92fb-32f9-4779-9cc0-42c1ce6dc72e). Aparecían dos registros en la tabla alf_node con el uuid del nodo con problemas, al intentar borrarlo aparecía un error por foreign key constraint fail sobre la tabla alf_node_assoc, de forma que primero borré los registros en esta última usando el alf_node (`id`) y luego ya me permitió borrar el nodo con problemas.
Reinicié el servicio de alfresco co la reindexación FULL y no aparecen errores.
Después ya pude borrar los ficheros citados.
Por ahora parece que todo va bien,
Espero que esta solución pueda ayudar a alguien.
Gracias