Ciao,
non è necessario che nel tuo file di configurazione siano riportate tutte le voci, se non hai bisogno di modificare le impostazioni di default.
Questo perchè il file alfresco-global.properties nella cartella share in realtà serve per sovrascrivere i parametri di default che sono già settati da un'altra parte.
Quindi puoi provare a ripulire il tuo file lasciando per il momento solo l'indicazione della cartella dir.root e la parte riguardante i driver del tuo database (la sezione ### database connection properties ###).
Controlla bene poi che siano settati correttamente i permessi sulla cartella /opt/alfresco-4.2.c/alf_data. Alfresco deve poter leggere e scrivere in essa.
Ti segnalo poi, dando un'occhiata veloce al file che hai postato, che i parametri alfresco.host e share.host sono settati ad un dominio errato (a meno che tu non abbia comprato miodominio.com!)
Riprova seguendo le indicazioni che ti ho dato e vedi se il tuo problema viene risolto.